ABURAME:É um clã muito famoso dentro e fora do País do Fogo, onde residem. São úteis pela sua habilidade de controlar insetos de variados tipos. Apesar de clãs parecidos existirem em outros Países, o Clã Aburame é o maior e o mais famoso. Para ganhar a ajuda dos pequenos seres vivos, são postos no corpo quando ainda é pequeno. Eles se alimentam do chakra do ninja, e em troca são usados na batalha pela manipulação do chakra.
AKIMICHI:Esse clã de Konoha é composto por membros de corpos obesos. Esse fator é a principal vantagem deles. Com o Baika no Jutsu, eles aumentam o tamanho e peso do corpo, e com isso ganham resistência de ataques e podem executar taijutsus de grande potência, como o Nikudan Sensha.
Dentro do clã existem outros jutsus relacionados ao uso de seus corpos, mas geralmente outros ninjutsus são usados em casos extremos, e com o auxílio das Pílulas Akimichi.
CLÃ DO HAKU:
Clã Koori é o suposto clã de quem Haku é membro, assim como sua mãe. Após a guerra civil no País da Água, todos se revoltaram contra os herdeiros de Kekkei Genkai, por considerarem perigosos demais para os habitantes. Foi por essa razão que o Clã Kaguya, também originário da Vila Oculta da Névoa, atacou os habitantes e acabou extinto.
Durante a guerra (que dizem ter sido iniciada pelo Clã Kaguya), Haku, ainda criança, desperta a Kekkei Genkai ao ver sua mãe, também portadora dessa habilidade, ser morta na sua frente pelo seu pai, que passou a temer e odiar sua família. Ao ver isso, Haku acaba matando todos com seu poder.
FUUMA:O clã Fuuma é pouco conhecido (só teve participação no anime sendo citado no mesmo por um ninja da chuva na investigação de Jiraiya sobre Orochimaru, pois estavam atras do Sasuke), o país de origem do clã é o país do arroz. O país do arroz teve a idéia de aumentar o fornecimento de comida, mas uma guerra iniciou-se. A guerra foi sediada no Reino Kingin, mas nesta guerra muitos shinobis morreram. O clã Fuuma perdeu a guerra junto com o país. As maiorias dos shinobis saíram do país.
HYUUGA:Muito respeitados dentro e fora da vila de Konoha, o Clã Hyuuga é um dos clãs mais poderosos no mundo Naruto,depois do Hokage e do Senhor Feudal eles formam a elite da Aldeia da Folha ocupando a posição de familia mais importante do País do Fogo. O clã hyuuga tem como principal característica o Byakugan, uma Kekkei Genkai extremamente poderosa. Os membros mais conhecidos são Hyuuga Neji, Hyuuga Hiashi, Hyuuga Hinata, Hyuuga Hanabi e Hyuuga Hizashi.
O clã é dividido em duas partes: a Família Principal e a Família Secundária. Na família principal, apenas o primeiro filho(a) continua nela. O segundo, o terceiro, e os outros que possam vir, farão parte da família secundária, cujo objetivo é proteger a Família Principal. Para que os membros da Família Secundaria não façam nada de errado, um selo é posto na cabeça deles quando pequenos. Qualquer ação que o membro da principal perceba, com apenas um selo de mão ele pode fazer o membro da Família Secundária tenha uma forte dor de cabeça, causada pela destruição de neurônios, podendo matá-lo. Outro uso do selo é selar todos os conhecimentos do Byakugan quando a pessoa morre, para evitar que o segredo do Byakugan saia do clã. Hyuuga Hiashi e suas filhas Hyuuga Hinata e Hyuuga Hanabi são da Família Principal, enquanto Hyuuga Neji e seu pai Hyuuga Hizashi são da Família Secundária. Hyuuga Hiashi e Hyuuga Hizashi são irmãos gêmeos, mas Hyuuga Hiashi foi para a Família Principal por nascer primeiro. Mesmo assim, o gênio do clã, Hyuuga Neji, o que foi abençoado com a kekkei genkai mais poderosa do clã nasceu na Família Secundária, o que deixa Hyuuga Hiashi numa posição difícil.
INUZUKA:É um clã do País do Fogo respeitado, com a peculiaridade de utilizar cachorros como companheiro nas lutas. O ninja recebe seu cão ainda pequeno. Os dois começam a criar uma existência amigável, até ao ponto do ninja entender o que o seu mascote tenta expressar por latidos e gestos. Os dois desenvolvem a confiança entre si.
A luta de um ninja desse clã é sempre fruto de uma aliança entre homem e cão. O cão, quase sempre grande, ataca com força bruta, com a ajuda da força e da estratégia do ninja. Para melhorar sua técnica, o ninja luta como se fosse um animal, aumentando o seu olfato com o acúmulo de chakra na região do nariz, lutando quase sempre de quatro, deixando os seus dentes afiados. Na hora da luta, os dois lutam de forma sincronizada. Para melhorar sua habilidade, é comum o uso de Pílulas do Soldado, que aumenta consideravelmente a força dos dois.
Os cães possuem a capacidade de sentir o "cheiro" da intensidade do chakra, criando assim uma possibilidade para uma retirada.
KAGUYA:Clã Kaguya era um Clã muito poderoso no país da água, na Vila Oculta da Névoa, por causa de sua Kekkei Genkai. Sempre que começava uma guerra era utilizados, o que fez seus membros ganharem um certo prazer nas guerras, e lutas em geral. Viraram um Clã militar, com interesse apenas na guerra. Se deliciaram com as batalhas da Terceira Guerra Secreta. Quando ela acabou, os membros desse Clã queriam mais, e pensaram em dar um golpe militar em um período de instabilidade da Vila Oculta da Névoa. Juntaram todos os membros do Clã e invadiram, foram massacrados, dizimados. Somente o jovem Kaguya Kimimaro sobreviveu e se aliou a Orochimaru ( que tinha o interesse de se apossar de seu corpo quando estivesse pronto).
KAMIZURU:O Clã Kamizurui é um Clã de usuários de insetos da Vila Oculta da Pedra, no País da Terra. Há muito tempo eles eram quase tão famosos quanto o Clã Aburame, mas agora o Clã foi esquecido, e atualmente estão em pequena quantidade. Este Clã só aparece no Anime, quando três membros estão numa importante missão: capturar o Bikouchuu para a restauração do Clã. O Clã Kamizurui tem uma certa "rivalidade" com o Clã Aburame, que foi o responsável pela queda do Clã Kamizurui, e agora eles querem vingança.
Quando o Clã Kamizurui estava no mesmo nível do Clã Aburame, na época do avô de Aburame Shino, eles (alguns shinobis da Vila Oculta da Pedra - Shinobis Kamizurui's) tentaram invadir Konoha. Eles trouxeram um exército de abelhas para a vila, e planejaram atacar em meio à confusão. Mas o Clã Aburame percebeu a tentativa de ataque, e esperou na floresta dos insetos. Deu-se a luta, com a vitória do Clã Aburame. Mais de mil pessoas foram mortas na batalha, mas em contrapartida, o Clã Kamizurui perdeu sua fama, mesmo dentro da Vila Oculta da Pedra. Agora, os membros conhecidos tentam capturar o Bikouchuu com o intuito de achar o pergaminho secreto (existem técnicas nele que são até proibidas, mesmo para os usuários de insetos).
NARA:Não é um Clã muito famoso nem grande. Na história de Konoha, é lembrado por deter um conhecimento medicinal excepcional. Tsunade recorreu a tal conhecimento para poder salvar Akimichi Chouji. No entanto, é mais conhecido por suas técnicas serem usadas para segurar um Shinobi (Ninja), enquanto chegava o time de apoio. Por isso, suas técnicas nunca foram próprias para batalha. Quando acontece do Shinobi (Ninja) desse Clã entrar num combate direto, ele sempre apresentava dificuldades. Para evitar problemas, o intelecto do Shinobi (Ninja) é treinado, para facilitar a criação de estratégias. Os membros conhecidos são Nara Shikaku, Nara Shikamaru e Nara Yoshino.
UCHIHA:O clã Uchiha, foi considerado um dos clãs mais poderosos que já existiu, ao lado do Clã Senju era o que fazia frente aos Uchihas. Foi considerado o clã lendário de Konoha, os Uchihas são descendente do filho mais velho do Eremita dos Seis Caminhos, anteriormente à criação de Aldeia da folha. Os membros do clã ao despertar o Sharingan, um olho vermelho com um, dois ou três tomões em volta da pupila, dependendo de seu desenvolvimento, desenvolve a habilidade de copiar ninjutsus, genjutsus e taijutsus com muita facilidade e armazená-los na mente para usá-los quando bem entender. Os descendentes do clã que despertam o sharingan, o herdam genéticamente, ou seja, somente tendo algum familiar que possua o Sharingan o usuário do clã o herdará. Outra maneira de se obter é fazendo um transplante de olhos (como é o caso do Hatake Kakashi e Danzou) para que outro usuário o tenha, mas com isso, o Sharingan não pode ser desativado, e como o Sharingan usa uma boa quantidade de chakra, normalmente o olho transplantado está coberto, pois os membros do clã que têm a linhagem avançada possuem bastante chakra para poder usá-lo, apesar de que, para os membros do clã, o sharingan quase não consome chakra, fazendo até que alguns membros do clã (como Uchiha Itachi e Tobi) use-o constantemente.
YAMANAKA:Também são um Clã conhecido na Vila Oculta da Folha, pois o clã possui uma loja de flores em Konoha chamada Yamanaka Flower Shop. Loja mostrada diversas vezes no Anime e no Mangá. Participou das guerras,e com essa participação,ficou conhecido por todos os cinco grandes paises ninja. Temido e conhecido,tem técnicas que afetam a mente e o corpo das pessoas além de seu integrantes terem um corpo muito flexível e muito forte,podendo assim desviar de ataques facilmente e atacar ataques poderosos